Molecular Detection of <i>Apiosporina morbosa</i>, Causal Agent of Black Knot in <i>Prunus virginiana</i>
Notice bibliographique
Résumé
A specific and sensitive polymerase chain reaction (PCR) assay was developed to detect Apiosporina morbosa, the causal agent of black knot disease on chokecherry, Prunus virginiana (including the cultivar 'Shubert Select'). A pair of A. morbosa-specific forward and reverse primers (AMF and AMR) was designed from the internal transcribed spacer (ITS) regions of A. morbosa, preamplified by universal ITS primers ITS1 and ITS4, and compared with the ITS region sequences of Fusarium, Alternaria, Phoma, and Cladosporium species associated with black knots. The primers were tested for their specificity to A. morbosa detection in the PCR assays using DNA derived from 64 pure cultures, including 42 single-spore isolates of A. morbosa and 22 isolates of other fungi, as well as healthy and diseased plant branches collected from the field. A product of ~400 bp was amplified from DNA of all isolates belonging to A. morbosa. No product was amplified from DNA of other fungal species, confirming the specificity of the newly designed primers. Within plant tissues, the pathogen was detected at further distances from the edges of knots on thicker branches bearing larger knots compared with thinner branches bearing smaller knots. The PCR assay has shown high sensitivity, needing only 100 fg of the A. morbosa DNA for a reliable PCR amplification with the AMF and AMR primers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».