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Enregistrement W2053532854 · doi:10.1080/07060661.2012.676571

Identification and validation of fusarium head blight and<i>Fusarium</i>-damaged kernel QTL in a Frontana/Remus DH mapping population

2012· article· en· W2053532854 sur OpenAlexvenueno aff
Ágnes Szabó-Hevér, Szabolcs Lehoczki-Krsjak, Beáta Tóth, L. Purnhauser, Hermann Buerstmayr, Barbara Steiner, Ákos Mesterházy

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusFusariumBiologyPopulationFusarium culmorumGeneticsDoubled haploidyFamily-based QTL mappingChromosomeGene mappingGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) is a devastating disease of wheat (Triticum aestivum L.). This study investigated a ‘Frontana/Remus’ doubled haploid population (n = 210 lines) to map and validate the ‘Frontana’ resistance quantitative trait loci (QTL) focusing on Fusarium-damaged kernels (FDK). The plant material was evaluated in six epidemic situations for Fusarium resistance in inoculated field experiments, with either Fusarium graminearum or F. culmorum. Other studies have focused on FHB QTL, but it is important to evaluate how far these QTL determine FDK values. The data show that the genetic regulation of FHB resistance is more complex than earlier proposed. FHB resistance QTL were identified on chromosomes 3A, 4A and 6B. Markers showed association with FDK resistance on chromosomes 3D and at the marker Xs12m15_4. QTL on 2B, 4B, 5A and 7B chromosomes were responsible for both FHB and FDK resistance; in this case, the same QTL influenced both traits and possibly other traits during disease development. These QTL are very important, because they can be considered to be real Fusarium resistance QTL. The use of markers in breeding programmes, which are associated only with FHB or FDK resistance may be questionable and require further research. Heading date QTL were detected on chromosomes 1A, 2D and 7B overlapping with neither FHB nor FDK resistance QTL. The QTL identified in the ‘Frontana/Remus’ population were in good agreement with earlier results from the literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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