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Enregistrement W2053620639 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs12-p2-10-09

Abstract P2-10-09: The incidence of false negative of HER2/Neu status in primary breast cancer in the era of standardized testing: a Canadian prospective study.

2012· article· en· W2053620639 sur OpenAlexaffabout
Wedad Hanna, Peter J. Barnes, MC Chang, B. Gilks, Anthony M. Magliocco, Huw Rees, Susan J. Robertson, SK Sengupta, Sharon Nofech‐Mozes

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensVancouver General HospitalOttawa HospitalKingston General HospitalSaskatoon City Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerTrastuzumabImmunohistochemistryInternal medicineOncologyIncidence (geometry)Fluorescence in situ hybridizationCancerCompanion diagnosticPathologyGynecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The efficacy of trastuzumab in the treatment of primary breast cancer has mandated accurate and timely testing of all patients with a new diagnosis of breast cancer. Testing is centralized in designated laboratories across Canada with adherence to guidelines and mandatory participation in quality assurance programs. The Canadian testing algorithm recommends starting with immunohistochemistry (IHC) followed by in situ hybridization (ISH) for equivocal cases. Early HER2 testing showed that approximately 25–30% of invasive breast cancer is HER2 positive. Recent data shows that the HER2/neu positive rate in breast cancer in Canada is 17.6%. Design: The study was designed to assess the rate of false-negative HER2 tests based on the IHC-first algorithm used in 8 pathology centres across Canada. Surgical excisions with invasive carcinoma were tested using the standardized local methodology for both IHC and ISH. The cases were scored by the local breast pathologist and in 2 of 8 centers image analysis was used in the evaluation of ISH. We compared consecutive HER2-negative IHC results (score 0/1+) to the corresponding ISH (either silver or fluorescence) result. False negative cases were defined as a negative IHC with an ISH ratio of≥ 2, since these patients are eligible for trastuzumab therapy. Results: 715 cases were analyzed by IHC using Ventana 4B5 (287), HercepTest (253), or SP3 (175), and by ISH kits: Vysis FISH (303), Ventana SISH (412). The HER2 and CEP17 counts were available in all cases. There were 4 cases with an ISH score ≥2 (4B5: 2/4, HercepTest 1/4, SP3 1/4). In 3 additional cases the absolute HER2 copy number was ≥6 but the HER2/CEP17 amplification ratio was <2 due to an increased number of CEP 17 signal (“polysomy 17”) or amplification of the pericentromeric region. The overall rate of false negative cases was 0.98% (7/715). These cases had a low level of amplification (ratio 2 to 2.45) or an absolute HER2 count of 6–8. Conclusion: Our observation confirms that IHC is an adequate test to predict negative HER2 status in primary breast cancer in surgical excision specimens, even when different antibodies and IHC platforms are used. The study supports and justifies the Canadian algorithm of IHC followed by ISH in equivocal cases in view of the extremely low percentage of false negative cases observed. This reflects the strict adherence to internal protocols and mandatory participation in quality assurance programs. These results provide further confirmation that the vast majority of patients eligible for trastuzumab are not deprived from an effective treatment by using this algorithm. Citation Information: Cancer Res 2012;72(24 Suppl):Abstract nr P2-10-09.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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