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Enregistrement W2053642429 · doi:10.1074/jbc.m410245200

Structural Basis for the Inactivity of Human Blood Group O2 Glycosyltransferase

2004· article· en· W2053642429 sur OpenAlexaff
Hojun Lee, C.H. Barry, S.N. Borisova, Nina O.L. Seto, Ruixiang Blake Zheng, Antoine Blancher, Stephen V. Evans, Monica M. Palcic

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversity of VictoriaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosyltransferaseBasis (linear algebra)Group (periodic table)Computational biologyBiologyChemistryBiochemistryMathematicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human ABO(H) blood group antigens are carbohydrate structures generated by glycosyltransferase enzymes. Glycosyltransferase A (GTA) uses UDP-GalNAc as a donor to transfer a monosaccharide residue to Fuc alpha1-2Gal beta-R (H)-terminating acceptors. Similarly, glycosyltransferase B (GTB) catalyzes the transfer of a monosaccharide residue from UDP-Gal to the same acceptors. These are highly homologous enzymes differing in only four of 354 amino acids, Arg/Gly-176, Gly/Ser-235, Leu/Met-266, and Gly/Ala-268. Blood group O usually stems from the expression of truncated inactive forms of GTA or GTB. Recently, an O(2) enzyme was discovered that was a full-length form of GTA with three mutations, P74S, R176G, and G268R. We showed previously that the R176G mutation increased catalytic activity with minor effects on substrate binding. Enzyme kinetics and high resolution structural studies of mutant enzymes based on the O(2) blood group transferase reveal that whereas the P74S mutation in the stem region of the protein does not appear to play a role in enzyme inactivation, the G268R mutation completely blocks the donor GalNAc-binding site leaving the acceptor binding site unaffected.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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