A novel gene R049 identified in uropathogenic Escherichia coli provides partial protection in mice from colonization
Notice bibliographique
Résumé
Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) is the most common causative organism of human urinary tract infection (UTI). Several UPEC virulence factors have been identified, but more are yet to be found. We previously identified a novel 789-bp-long DNA fragment (named R049) in UPEC strain 132 using a suppressive subtractive hybridization technique. In the present study, we used genome walking to elongate the sequence of this fragment to obtain the whole gene sequence and examined the role of this gene product in generating protective immunity. Through bioinformatic analysis, we predicted that this gene is a 1311-bp open reading frame (ORF), which we designated ORF R049 (GenBank accession No.: EF488001). We further constructed a prokaryotic expression system to express full recombinant R049 protein and isolated and purified the protein through IPTG induction and nickel affinity chromatography. Using mouse immunosera generated by the purified protein, we confirmed the natural expression and outer membrane localization of the protein in wild-type strain UPEC132 by Western blotting. To test the potential of this protein as a vaccine candidate, we immunized mice with the recombinant protein before challenging them with UPEC132 through the urinary tract. The results showed significantly reduced bacterial colonization in the urine and kidneys of the immunization group compared with the control group. However, the degree of renal pathological damage was not significantly improved in the immunized mice. Our study has identified a novel gene of UPEC which can generate protective immunity against UTI. This novel gene provides a promising new vaccine candidate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».