Structural Basis of Membrane Targeting by the Dock180 Family of Rho Family Guanine Exchange Factors (Rho-GEFs)
Notice bibliographique
Résumé
The Dock180 family of atypical Rho family guanine nucleotide exchange factors (Rho-GEFs) regulate a variety of processes involving cellular or subcellular polarization, including cell migration and phagocytosis. Each contains a Dock homology region-1 (DHR-1) domain that is required to localize its GEF activity to a specific membrane compartment where levels of phosphatidylinositol (3,4,5)-trisphosphate (PtdIns(3,4,5)P(3)) are up-regulated by the local activity of PtdIns 3-kinase. Here we define the structural and energetic bases of phosphoinositide specificity by the DHR-1 domain of Dock1 (a GEF for Rac1), and show that DHR-1 utilizes a C2 domain scaffold and surface loops to create a basic pocket on its upper surface for recognition of the PtdIns(3,4,5)P(3) head group. The pocket has many of the characteristics of those observed in pleckstrin homology domains. We show that point mutations in the pocket that abolish phospholipid binding in vitro ablate the ability of Dock1 to induce cell polarization, and propose a model that brings together recent mechanistic and structural studies to rationalize the central role of DHR-1 in dynamic membrane targeting of the Rho-GEF activity of Dock180.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».