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Enregistrement W2054177024 · doi:10.1101/gad.256115.114

Essential roles for the splicing regulator nSR100/SRRM4 during nervous system development

2015· article· en· W2054177024 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésBiologyRegulatorRNA splicingAlternative splicingNervous systemCell biologyComputational biologyGeneticsNeuroscienceGeneRNAMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alternative splicing (AS) generates vast transcriptomic complexity in the vertebrate nervous system. However, the extent to which trans-acting splicing regulators and their target AS regulatory networks contribute to nervous system development is not well understood. To address these questions, we generated mice lacking the vertebrate- and neural-specific Ser/Arg repeat-related protein of 100 kDa (nSR100/SRRM4). Loss of nSR100 impairs development of the central and peripheral nervous systems in part by disrupting neurite outgrowth, cortical layering in the forebrain, and axon guidance in the corpus callosum. Accompanying these developmental defects are widespread changes in AS that primarily result in shifts to nonneural patterns for different classes of splicing events. The main component of the altered AS program comprises 3- to 27-nucleotide (nt) neural microexons, an emerging class of highly conserved AS events associated with the regulation of protein interaction networks in developing neurons and neurological disorders. Remarkably, inclusion of a 6-nt, nSR100-activated microexon in Unc13b transcripts is sufficient to rescue a neuritogenesis defect in nSR100 mutant primary neurons. These results thus reveal critical in vivo neurodevelopmental functions of nSR100 and further link these functions to a conserved program of neuronal microexon splicing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,728

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle