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Enregistrement W2054189266 · doi:10.1074/jbc.m006229200

Molecular and Cellular Properties of the Rat AA4 Antigen, a C-type Lectin-like Receptor with Structural Homology to Thrombomodulin

2000· article· en· W2054189266 sur OpenAlexaff
Yann Dean, Eamon P. McGreal, Hiroyasu Akatsu, Philippe Gasque

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésLectinHomology (biology)C-type lectinReceptorAntigenBiologyComputational biologyMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The murine fetal stem cell marker AA4 has recently been cloned and is known to be the homolog of the human phagocytic C1q receptor involved in host defense. We herein report the molecular cloning and the cellular expression pattern of the rat AA4 antigen. Modular architecture analysis indicated that the rat AA4 is a member of C-type lectin-like family and, interestingly, displays similar domain composition and organization to thrombomodulin. Northern blot and reverse transcriptase-polymerase chain reaction analyses indicated that rat AA4 was encoded by a single transcript of 7 kilobases expressed constitutively in all tissues. In situ hybridization showed that AA4 was expressed predominantly by pneumocytes and vascular endothelial cells. Using an affinity purified polyclonal antibody raised against a rat AA4-Fc fusion protein, AA4 was identified as a glycosylated protein of 100 kDa expressed by endothelial cells > platelets > NK cells and monocytes (ED1+ cells). The staining was associated to the cell surface and intracytoplasmic vesicles. Conversely, erythrocytes, T and B lymphocytes, neutrophils, and macrophages (ED2+ cells) were consistently negative for AA4. As expected, the macrophage cell line NR8383 expressed weak levels of AA4. Taken together, our results support the idea that AA4/C1qRp is involved in some cell-cell interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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