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Enregistrement W2054194363 · doi:10.1111/liv.12222

Characterization of hepatitis B virus genotypes and quantitative hepatitis B surface antigen titres in North American tertiary referral liver centres

2013· article· en· W2054194363 sur OpenAlexafffundabout
Stephen E. Congly, Philip Wong, Said A. Al‐Busafi, Karen Doucette, Scott Fung, Peter Ghali, Kevin Fonseca, Robert P. Myers, Carla Osiowy, Carla S. Coffin

Notice bibliographique

RevueLiver International · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthUniversity of TorontoRoyal Victoria HospitalRoyal Victoria Regional Health CentreUniversity of AlbertaMcGill University Health CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill UniversityRoche Canada
Mots-clésGenotypeHepatitis B virusMedicineHepatitis BVirologyGastroenterologyInternal medicineTaqManBiologyPolymerase chain reactionVirusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & AIMS: Hepatitis B virus (HBV) genotype and quantitative hepatitis B surface antigen (qHBsAg) have been related to clinical outcome. In this nationwide cross-sectional study, we aimed to investigate the epidemiology and clinical significance of HBV genotype and qHBsAg in patients with chronic hepatitis B (CHB). METHODS: Six hundred and thirty patients with CHB were seen in four urban tertiary referral centres in Canada. HBV genotype was determined by line probe assay (INNO-LIPA) and HBV DNA quantified by commercial PCR (Roche TaqMan, sensitivity <55 IU/ml or AMPLICOR, sensitivity <60 IU/ml). Titres of qHBsAg were determined by an in-house assay based on the WHO standard (calibration range 0.24-62.5 IU/ml). RESULTS: In 630 patients (57% male, 69% Asian, median age 42 years), 21% were hepatitis B e antigen positive and the median alanine aminotransferase was 29 U/L. The HBV genotype distribution was A (16%), B (29%), C (31%), D (16%), E (6%). HBV genotype was strongly associated with ethnicity, but neither genotype nor qHBsAg correlated with the degree of fibrosis. In the treatment-naïve patients, the baseline qHBsAg levels correlated with HBV DNA (r = 0.2517, P < 0.0008). The median qHBsAg levels were lowest in patients with genotype B (P < 0.0001), but no significant correlation was noted with all other HBV genotypes. CONCLUSIONS: In this large North American HBV epidemiological study, genotypes B and C were the most common; however, all genotypes (A-E) were observed with varied distribution nationwide. Baseline qHBsAg significantly correlated with HBV DNA and with HBV genotype B, but not with liver fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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