Development of chloroplast‐specific microsatellite markers for molecular characterization of alloplasmic lines and phylogenetic analysis in wheat
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Wheat (Triticum aestivum L.) is strictly a self‐pollinated crop, where hybrid breeding requires well‐characterized cytoplasmic male sterile (CMS) lines. The CMS has mostly been developed by substituting nuclear genome of wheat into the cytoplasm from wild relatives. Molecular characterization of 90 genotypes including 82 CMS lines originating from five different species, namely Aegilops speltoides, Ae. kotschyi, Ae. variabilis, Triticum araraticum and T. timopheevii, and eight popular varieties was carried out. Consequently, a set of 25 microsatellite markers specific to chloroplast (cpSSRs) were designed and successfully validated for specificity of amplification. A total of 15 cpSSRs (60%) were found polymorphic, of which three cpSSRs (TaCM7, TaCM8 and TaCM11) in genic region and twelve cpSSRs were located in intergenic region. Phylogenetic analysis of genotypes using cpSSRs revealed two major groups well in accordance with respective origin. A set of cpSSRs and phylogeny of CMS belonging to different origins developed, which will be helpful for the improvement in CMS system in wheat. The genic cpSSRs can be used for the allele mining and evolutionary studies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».