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Enregistrement W2054352267 · doi:10.1371/journal.pntd.0000305

Leishmania-Induced IRAK-1 Inactivation Is Mediated by SHP-1 Interacting with an Evolutionarily Conserved KTIM Motif

2008· article· en· W2054352267 sur OpenAlexafffund
Issa Abu‐Dayyeh, Marina Tiemi Shio, Shintaro Sato, Shizuo Akira, Benoit Cousineau, Martin Olivier

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyProtein tyrosine phosphataseInnate immune systemKinasePhosphataseCell biologyLYNProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTyrosine kinaseSignal transductionReceptorPhosphorylationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parasites of the Leishmania genus can rapidly alter several macrophage (MØ) signalling pathways in order to tame down the innate immune response and inflammation, therefore favouring their survival and propagation within their mammalian host. Having recently reported that Leishmania and bacterial LPS generate a significantly stronger inflammatory response in animals and phagocytes functionally deficient for the Src homology 2 domain-containing protein tyrosine phosphatase (SHP-1), we hypothesized that Leishmania could exploit SHP-1 to inactivate key kinases involved in Toll-like receptor (TLR) signalling and innate immunity such as IL-1 receptor-associated kinase 1 (IRAK-1). Here we show that upon infection, SHP-1 rapidly binds to IRAK-1, completely inactivating its intrinsic kinase activity and any further LPS-mediated activation as well as MØ functions. We also demonstrate that the SHP-1/IRAK-1 interaction occurs via an evolutionarily conserved ITIM-like motif found in the kinase domain of IRAK-1, which we named KTIM (Kinase Tyrosyl-based Inhibitory Motif). This regulatory motif appeared in early vertebrates and is not found in any other IRAK family member. Our study additionally reveals that several other kinases (e.g. Erk1/2, IKKalpha/beta) involved in downstream TLR signalling also bear KTIMs in their kinase domains and interact with SHP-1. We thus provide the first demonstration that a pathogen can exploit a host protein tyrosine phosphatase, namely SHP-1, to directly inactivate IRAK-1 through a generally conserved KTIM motif.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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