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Enregistrement W2054418404 · doi:10.1074/jbc.m308775200

Translocation of Group 1 Capsular Polysaccharide in Escherichia coli Serotype K30

2003· article· en· W2054418404 sur OpenAlexaff
Jutta Nesper, Chris M.D. Hill, Anne Paiment, George Harauz, Konstantinos Beis, James H. Naismith, Chris Whitfield

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterial outer membranePeriplasmic spaceCapsuleEscherichia coliMembraneBacterial capsuleBiophysicsNegative stainCrystallographyBiologyCapsidChemistryElectron microscopeBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The late steps in assembly of capsular polysaccharides (CPS) and their translocation to the bacterial cell surface are not well understood. The Wza protein was shown previously to be required for the formation of the prototype group 1 capsule structure on the surface of Escherichia coli serotype K30 (Drummelsmith, J., and Whitfield, C. (2000) EMBO J. 19, 57-66). Wza is a conserved outer membrane lipoprotein that forms multimers adopting a ringlike structure, and collective evidence suggests a role for these structures in the export of capsular polymer across the outer membrane. Wza was purified in the native form and with a C-terminal hexahistidine tag. WzaHis6 was acylated and functional in capsule assembly, although its efficiency was slightly reduced in comparison to the native Wza protein. Ordered two-dimensional crystals of WzaHis6 were obtained after reconstitution of purified multimers into lipids. Electron microscopy of negatively stained crystals and Fourier filtering revealed ringlike multimers with an average outer diameter of 8.84 nm and an average central cavity diameter of 2.28 nm. Single particle analysis yielded projection structures at an estimated resolution of 3 nm, favoring a structure for the WzaHis6 containing eight identical subunits. A derivative of Wza (Wza*) in which the original signal sequence was replaced with that from OmpF showed that the native acylated N terminus of Wza is critical for formation of normal multimeric structures and for their competence for CPS assembly, but not for targeting Wza to the outer membrane. In the presence of Wza*, CPS accumulated in the periplasm but was not detected on the cell surface. Chemical cross-linking of intact cells suggested formation of a transmembrane complex minimally containing Wza and the inner membrane tyrosine autokinase Wzc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,441

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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