Large-Scale Proteome Profile of the Zebrafish ( <i>Danio rerio</i> ) Gill for Physiological and Biomarker Discovery Studies
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Zebrafish are an important model in vertebrate genetics, developmental biology, physiology, and toxicology. In this study, we established the first large-scale proteome profile of a teleost fish tissue using a shotgun method based on two-dimensional liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry. Proteome coverage was significantly improved with the application of a sequential protein solubilization method for protein fractionation and a precursor ion exclusion method for improving peptide and protein identification efficiency. Five thousand seven hundred sixteen proteins were identified with an estimated false-positive matching rate of 1.34%, and the proteome exhibited excellent coverage of important biochemical pathways relevant to the function of the gill in respiration, ion and acid-base homeostasis, and energy metabolism. Numerous established and potential biomarkers of stress, disease, and environmental contamination were also expressed in the gill. Annotation information was completely lacking for >30% of the detected proteins, highlighting the need for advancements in bioinformatics analysis techniques to complement this research. Nevertheless, the results provide important insights into the physiological function of the gill as well as its role as an environmental interface. We discuss the significance of these findings in the context of exploratory physiological and toxicological studies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle