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Enregistrement W2054588990 · doi:10.1073/pnas.1220847110

CaBP1, a neuronal Ca <sup>2</sup> <sup>+</sup> sensor protein, inhibits inositol trisphosphate receptors by clamping intersubunit interactions

2013· article· en· W2054588990 sur OpenAlexafffund
Congmin Li, Masahiro Enomoto, Ana M. Rossi, Min‐Duk Seo, Taufiq Rahman, Peter B. Stathopulos, Colin W. Taylor, Mitsuhiko Ikura, James B. Ames

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeWellcome TrustNational Eye InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemistryBiophysicsCalmodulinBinding siteReceptorBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium-binding protein 1 (CaBP1) is a neuron-specific member of the calmodulin superfamily that regulates several Ca(2+) channels, including inositol 1,4,5-trisphosphate receptors (InsP3Rs). CaBP1 alone does not affect InsP3R activity, but it inhibits InsP3-evoked Ca(2+) release by slowing the rate of InsP3R opening. The inhibition is enhanced by Ca(2+) binding to both the InsP3R and CaBP1. CaBP1 binds via its C lobe to the cytosolic N-terminal region (NT; residues 1-604) of InsP3R1. NMR paramagnetic relaxation enhancement analysis demonstrates that a cluster of hydrophobic residues (V101, L104, and V162) within the C lobe of CaBP1 that are exposed after Ca(2+) binding interact with a complementary cluster of hydrophobic residues (L302, I364, and L393) in the β-domain of the InsP3-binding core. These residues are essential for CaBP1 binding to the NT and for inhibition of InsP3R activity by CaBP1. Docking analyses and paramagnetic relaxation enhancement structural restraints suggest that CaBP1 forms an extended tetrameric turret attached by the tetrameric NT to the cytosolic vestibule of the InsP3R pore. InsP3 activates InsP3Rs by initiating conformational changes that lead to disruption of an intersubunit interaction between a "hot-spot" loop in the suppressor domain (residues 1-223) and the InsP3-binding core β-domain. Targeted cross-linking of residues that contribute to this interface show that InsP3 attenuates cross-linking, whereas CaBP1 promotes it. We conclude that CaBP1 inhibits InsP3R activity by restricting the intersubunit movements that initiate gating.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,548

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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