Numerical analysis of small Arctic diatoms (Bacillariophyceae) representing the <i>Staurosira</i> and <i>Staurosirella</i> species complexes
Notice bibliographique
Résumé
T.M. Paull, P.B. Hamilton, K. Gajewski and M. LeBlanc. 2008. Numerical analysis of small Arctic diatoms (Bacillariophyceae) representing the Staurosira and Staurosirella species complexes. Phycologia 47: 213–224. DOI:10.2216/07-17.1Small benthic fragilarioid diatoms (Bacillariophyceae) are dominant taxa in circumpolar Arctic lakes and ponds. These small forms are difficult to identify under light microscope (LM) because of valve size, the limited number of visible characters, and considerable morphological variability within populations. For this reason, ultrastructural characters visible only under a scanning electron microscope (SEM) such as areolae and spine structure are usually recommended for species- and even genus-level identification. This is, however, often impractical. In this study we show that selected characters of Staurosirella pinnata (Ehrenberg) Williams & Round and Staurosira venter (Ehrenberg) Cleve & Möller measurable under LM correlate with diagnostic characters that can only be evaluated under SEM. We measured 32 morphological characters from SEM observations of 510 valves representing Staurosirella pinnata sensu Hustedt, Staurosira venter sensu Hustedt, and two morphologically distinct forms of S. venter sensu lato from lakes in Canada, Fennoscandia, and Siberia. Specimens from the circumpolar Arctic region identified as Staurosirella pinnata can be distinguished from Staurosira venter sensu lato using valve width and areola length (at margin), both visible under LM. Specimens with areolae lengths (at margin) larger than 0.4 µm are Staurosirella pinnata. For specimens with areolae lengths (at margin) smaller than 0.4 µm, those with valves wider than 2.9 µm are Staurosira venter sensu lato, whereas those with valves smaller than 2.9 µm are Staurosirella pinnata. Application of these numerical criteria allows for correct identification of 94% of specimens to either Staurosira venter (including morphotypes) or Staurosirella pinnata.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».