Frequent Inactivation of PTEN by Promoter Hypermethylation in Microsatellite Instability-High Sporadic Colorectal Cancers
Notice bibliographique
Résumé
Loss of PTEN tumor suppressor function is observed in tumors of breast, prostate, thyroid, and endometrial origin. Allelic losses in the proximity of the PTEN locus (10q23) also occur in sporadic colorectal cancers (CRCs), but biallelic inactivation of this site has not been frequently demonstrated. We hypothesized that alternative mechanisms of PTEN allelic inactivation, such as promoter hypermethylation, might be operative in CRC and that PTEN inactivation may be related to recognized forms of genomic instability. We characterized a cohort of 273 sporadic CRCs by determining their microsatellite instability (MSI) status. Of these, 146 cancers were examined for PTEN promoter methylation by methylation-specific PCR. Mutations at the poly(A)6 repeat sequences in PTEN exons 7 and 8 and deletions at the 10q23 locus were also identified using microsatellite analysis. The presence of PTEN protein was determined by immunostaining, and the results were correlated with the promoter methylation status. We observed that PTEN promoter hypermethylation was a frequent occurrence in MSI-high (MSI-H) tumors (19.1% of MSI-H versus 2.2% of MSI-low/microsatellite stable tumors; P = 0.002). A PTEN mutation or a deletion event was present in 60% of the tumors with promoter region hypermethylation. Hypermethylation of the PTEN promoter correlated significantly with either decreased or complete loss of PTEN protein expression (P = 0.004). This is the first demonstration of PTEN inactivation as a result of promoter hypermethylation in MSI-H sporadic CRCs. These data suggest that this silencing mechanism plays a major role in PTEN inactivation and, in colon cancer, may be more important than either allelic losses or inactivating mutations. The significant correlation of PTEN hypermethylation with MSI-H tumors further suggests that PTEN is an additional important "target" of methylation along with the hMLH1 gene in the evolution of MSI-H CRCs and also confers the "second hit" in the biallelic inactivation mechanism for some proportion of tumors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».