Inactivation mechanism of the β-ketoacyl-[acyl carrier protein] reductase of bacterial type-II fatty acid synthase by epigallocatechin gallate
Notice bibliographique
Résumé
Epigallocatechin gallate (EGCG), a major compound from green tea, reversibly inhibits beta-ketoacyl-[acyl carrier protein] reductase (FabG) from Escherichia coli. In this study, we found that EGCG exhibited an atypical time-dependent inhibition of FabG, which possibly resulted from the EGCG-induced aggregation of FabG. It was observed that FabG inactivation and aggregation occurred nearly simultaneously, with a lag time that decreased with increasing EGCG concentration. These results suggest that some chemical reactions, required for aggregation and inactivation, occurred during the lag time. Since EGC was detected by HPLC after the incubation of EGCG with FabG, EGCG probably covalently modified FabG. These further results showed that 1 tetramer of FabG must be modified by several, possibly 4, EGCG molecules before the formation of FabG aggregates. FabG aggregation was a first-order reaction independent of protein concentration. Due to an initial lag time, the first-order rate of aggregation gradually increased, reaching a maximal and constant value. The effect of increasing concentration of EGCG on the first-order rate constant for aggregation indicated that EGCG bound to FabG by affinity labeling. Based on the results, we propose a mechanism for the interaction of EGCG with FabG:EGCG first binds reversibly to each subunit of FabG, followed by covalent modification and then aggregation of the 4 EGCG-modified subunits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».