The Gastrointestinal Phenotype of Germline Biallelic Mismatch Repair Gene Mutations
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: A novel cancer syndrome associated with biallelic mismatch repair (MMR) mutations has been described recently. Patients presenting with childhood-onset gastrointestinal (GI) cancers may carry biallelic MMR mutations and have a distinct phenotype from classic Lynch syndrome. The aim of this study was to characterize patients with GI small bowel and/or colorectal cancers (CRCs) who have germline biallelic MMR mutations. METHODS: A search of a Canadian GI cancer registry and literature review to identify patients with biallelic MMR was conducted. RESULTS: The database identified 237 patients with intestinal cancer diagnosed before the age of 35 years. Five (2.1%) patients had biallelic MMR mutations. Overall, 32 individuals, from 29 families, with biallelic MMR gene mutations and GI cancers were identified by the registry and literature review. Among the 29 patients with CRCs, the mean age of first cancer diagnosis was 16.4 years (range: 5-28). More than one-third of patients had multiple colorectal adenomas (>10 polyps). Six individuals with biallelic MMR gene mutations have been reported with small bowel adenocarcinoma (mean age 20 years (range: 11-41)). Café-au-lait (CAL) macules were reported in 72% and, based on mutation analysis, consanguinity was suspected in 52% of kindred. Of the 29 kindred, 19 (66%) had PMS2 mutations, 6 (21%) had MSH6 mutations, 3 (10%) had MLH1 mutations, and 1 (3%) had MSH2 mutation. CONCLUSIONS: Biallelic MMR mutations are an underrecognized cause of small bowel and colonic cancers in children and young adults. This distinct phenotype includes multiple adenomatous polyps and CAL skin lesions. It is important to identify such patients, so that families can be referred for genetic testing and counseling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».