Replication of the association of <scp>GLT</scp>6<scp>D</scp>1 with aggressive periodontitis in a <scp>S</scp>udanese population
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Susceptibility to aggressive periodontitis (AgP) is influenced by genetic as well as environmental factors. Studies linking gene variants to AgP have been mainly centred in developed countries with limited data from Africa. AIM: To investigate whether previously reported candidate gene associations with AgP could be replicated in a population from Sudan. METHODS: The investigation was a case-control design. Cases with AgP (n = 132) and controls (n = 136) were identified from patients attending the Periodontal Department in Khartoum Dental Hospital. Genotyping was performed using the Sequenom MassARRAY iPLEX platform. Analysis focused on gene variants with a minor allele frequency (MAF) > 25% in the Sudanese subjects that had previously been reported to be associated with AgP. RESULTS: One candidate gene rs1537415 (GLT6D1) was significantly associated with AgP, OR = 1.50 (95% CI 1.04-2.17), p = 0.0295 (increasing to p = 0.09 after correction for multiple testing). The association strengthened to OR = 1.56 (95% CI 1.15-2.16), p = 0.0042 when the controls were supplemented with data from the Hap map for the Yoruba in Ibadan (n = 147) and remained significant (p = 0.013) after correction for multiple testing. CONCLUSION: The study independently replicated the finding that rs1537415, a variant in glycosyl transferase gene GLT6D1, is associated with AgP and provided the first report of genetic associations with AgP in a Sudanese population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,083 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».