Development of a polymerase chain reaction assay for detection of three canola transgenes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Many countries are developing or implementing regulatory requirements to monitor for the presence of genetically modified (GM) materials in seeds, grain, and derived food products using DNA and protein‐based methods. There is no published report on the detection of different GM transgenes in canola, and this study is aimed at developing qualitative PCR methods for the three major GM transgenes commercially available in canola. Primer sequences were generated from Gen‐Bank and previously published information to develop a polymerase chain reaction (PCR) detection method for Roundup Ready (glyphosate tolerance, GT73 event), Liberty Link (glufosinate ammonium tolerance, HCN92 event), and BX (Bromoxynil tolerance, OXY235 event) canola varieties. On using PCR, two primer pairs for each of the GT73 and HCN92 and one primer pair for OXY235 amplified specific amplicons for the three GM transgenes. All three GM transgenes were detected simultaneously by multiplexing the five primer pairs in a single PCR reaction. Multiplexing of the five primer pairs for DNA prepared at 1% (one GM seed in 99 non‐GM seeds) and 0.5% (one GM seed in 199 non‐GM seeds) levels generated the expected DNA fragments for GT73, HCN92, and OXY235. This information will lay the groundwork for the development of a quantitative PCR assay for canola transgenic events.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».