Molecular determinants involved in activation of caspase 7
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
During apoptosis, initiator caspases (8, 9 and 10) activate downstream executioner caspases (3, 6 and 7) by cleaving the IDC (interdomain connector) at two sites. Here, we demonstrate that both activation sites, site 1 and site 2, of caspase 7 are suboptimal for activation by initiator caspases 8 and 9 in cellulo, and in vitro using recombinant proteins and activation kinetics. Indeed, when both sites are replaced with the preferred motifs recognized by either caspase 8 or 9, we found an up to 36-fold improvement in activation. Moreover, cleavage at site 1 is preferred to site 2 because of its location within the IDC, since swapping sites does not lead to a more efficient activation. We also demonstrate the important role of Ile195 of site 1 involved in maintaining a network of contacts that preserves the proper conformation of the active enzyme. Finally, we show that the length of the IDC plays a crucial role in maintaining the necessity of proteolysis for activation. In fact, although we were unable to generate a caspase 7 that does not require proteolysis for activity, shortening the IDC of the initiator caspase 8 by four residues was sufficient to confer a requirement for proteolysis, a key feature of executioner caspases. Altogether, the results demonstrate the critical role of the primary structure of caspase 7's IDC for its activation and proteolytic activity.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle