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Enregistrement W2055141813 · doi:10.18388/abp.2008_3217

Amino acid substitutions of His296 alter the catalytic properties of Zymomonas mobilis 10232 levansucrase.

2008· article· en· W2055141813 sur OpenAlexaff
Shu Ying Li, Ming Chen, Gang Li, Yong Liang Yan, Hai Ying Yu, Yu Hua Zhan, Zi Xin Peng, Jin Wang, Min Lin

Notice bibliographique

RevueActa Biochimica Polonica · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMicrobial Metabolites in Food Biotechnology
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZymomonas mobilisLevansucraseChemistryAmino acidHydrolysisBiochemistryMutagenesisMutantSite-directed mutagenesisStereochemistryEthanolBiologyBacteriaBacillus subtilis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

His296 of Zymomonas mobilis levansucrase (EC 2.4.1.10) is crucial for the catalysis of the transfructosylation reaction. The three-dimensional structures of levansucrases revealed the His296 is involved in the substrate recognition and binding. In this study, nine mutants were created by site-directed mutagenesis, in which His296 was substituted with amino acids of different polarity, charge and length. The substitutions of His296 with Arg or Trp retained partial hydrolysis and transfructosylation activities. The positively charged Lys substitution resulted in a 2.5-fold increase of sucrose hydrolysis. Substitutions with short (Cys or Ser), negatively charged (Glu) or polar (Tyr) amino acids virtually abolished both the activities. Analysis of transfructosylation products indicated that the mutants synthesized different oligosaccharides, suggesting that amino acid substitutions of His296 strongly affected both the enzyme activity and transfructosylation products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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