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Enregistrement W2055155951 · doi:10.3402/jev.v3.23592

Characterization of physical properties of tissue factor–containing microvesicles and a comparison of ultracentrifuge‐based recovery procedures

2014· article· en· W2055155951 sur OpenAlexfundno aff
Camille Ettelaie, Mary E.W. Collier, Anthony Maraveyas, Rammile Ettelaie

Notice bibliographique

RevueJournal of Extracellular Vesicles · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMicrovesiclesUltracentrifugeChemistryComputer scienceChromatographyBiochemistrymicroRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microvesicles were isolated from the conditioned media of 3 cell lines (MDA-MB-231, AsPC-1 and A375) by ultracentrifugation at a range of relative centrifugal forces, and the tissue factor (TF) protein and activity, microvesicle number, size distribution and relative density compared. Also, by expressing TF-tGFP in cells and isolating the microvesicles, the relative density of TF-containing microvesicles was established. Nanoparticle tracking analysis (NTA) indicated that the larger-diameter microvesicles (>200 nm) were primarily sedimented at 100,000g and possessed TF-dependent thrombin and factor Xa generation potential, while in the absence of factor VII, all microvesicles possessed some thrombin generation capacity. Immuno-precipitation of TF-containing microvesicles followed by NTA also indicated the range of these microvesicles to be 200-400 nm. Analysis of the microvesicles by gradient density centrifugation showed that lower-density (<1.1 g/ml) microvesicles were mainly present in the samples recovered at 100,000g and were associated with TF antigen and activity. Analysis of these fractions by NTA confirmed that these fractions were principally composed of the larger-diameter microvesicles. Similar analysis of microvesicles from healthy or patient plasma supported those obtained from conditioned media indicating that TF activity was mainly associated with lower-density microvesicles. Furthermore, centrifugation of healthy plasma, supplemented with TF-tGFP-containing microvesicles, resulted in 67% retrieval of the fluorescent microvesicles at 100,000g, but only 26% could be recovered at 20,000g. Pre-centrifugation of conditioned media or plasma at 10,000g improved the speed and yield of recovered TF-containing microvesicles by subsequent centrifugation at either 20,000g or 100,000g. In conclusion, TF appears to be associated with low-density (1.03-1.08 g/ml), larger-diameter (200-350 nm) microvesicles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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