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Enregistrement W2055285499 · doi:10.1074/jbc.m110.109223

AnhE, a Metallochaperone Involved in the Maturation of a Cobalt-dependent Nitrile Hydratase

2010· article· en· W2055285499 sur OpenAlexafffund
Sachi Okamoto, Filip Van Petegem, Marianna A. Patrauchan, Lindsay D. Eltis

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Catalysis and Immobilization
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome Canada
Mots-clésNitrile hydrataseChemistryCobaltDimerAcetonitrileIsothermal titration calorimetryStereochemistryHexacoordinateHistidineCrystallographyBiochemistryEnzymeInorganic chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acetonitrile hydratase (ANHase) of Rhodococcus jostii RHA1 is a cobalt-containing enzyme with no significant sequence identity with characterized nitrile hydratases. The ANHase structural genes anhA and anhB are separated by anhE, predicted to encode an 11.1-kDa polypeptide. An anhE deletion mutant did not grow on acetonitrile but grew on acetamide, the ANHase reaction product. Growth on acetonitrile was restored by providing anhE in trans. AnhA could be used to assemble ANHase in vitro, provided the growth medium was supplemented with 50 μM CoCl2. Ten- to 100-fold less CoCl2 sufficed when anhE was co-expressed with anhA. Moreover, AnhA contained more cobalt when produced in cells containing AnhE. Chromatographic analyses revealed that AnhE existed as a monomer-dimer equilibrium (100 mm phosphate, pH 7.0, 25 °C). Divalent metal ions including Co2+, Cu2+, Zn2+, and Ni2+ stabilized the dimer. Isothermal titration calorimetry studies demonstrated that AnhE binds two half-equivalents of Co2+ with Kd of 0.12 ± 0.06 nm and 110 ± 35 nm, respectively. By contrast, AnhE bound only one half-equivalent of Zn2+ (Kd = 11 ± 2 nm) and Ni2+ (Kd = 49 ± 17 nm) and did not detectably bind Cu2+. Substitution of the sole histidine residue did not affect Co2+ binding. Holo-AnhE had a weak absorption band at 490 nm (ϵ = 9.7 ± 0.1 m−1 cm−1), consistent with hexacoordinate cobalt. The data support a model in which AnhE acts as a dimeric metallochaperone to deliver cobalt to ANHase. This study provides insight into the maturation of NHases and metallochaperone function. Acetonitrile hydratase (ANHase) of Rhodococcus jostii RHA1 is a cobalt-containing enzyme with no significant sequence identity with characterized nitrile hydratases. The ANHase structural genes anhA and anhB are separated by anhE, predicted to encode an 11.1-kDa polypeptide. An anhE deletion mutant did not grow on acetonitrile but grew on acetamide, the ANHase reaction product. Growth on acetonitrile was restored by providing anhE in trans. AnhA could be used to assemble ANHase in vitro, provided the growth medium was supplemented with 50 μM CoCl2. Ten- to 100-fold less CoCl2 sufficed when anhE was co-expressed with anhA. Moreover, AnhA contained more cobalt when produced in cells containing AnhE. Chromatographic analyses revealed that AnhE existed as a monomer-dimer equilibrium (100 mm phosphate, pH 7.0, 25 °C). Divalent metal ions including Co2+, Cu2+, Zn2+, and Ni2+ stabilized the dimer. Isothermal titration calorimetry studies demonstrated that AnhE binds two half-equivalents of Co2+ with Kd of 0.12 ± 0.06 nm and 110 ± 35 nm, respectively. By contrast, AnhE bound only one half-equivalent of Zn2+ (Kd = 11 ± 2 nm) and Ni2+ (Kd = 49 ± 17 nm) and did not detectably bind Cu2+. Substitution of the sole histidine residue did not affect Co2+ binding. Holo-AnhE had a weak absorption band at 490 nm (ϵ = 9.7 ± 0.1 m−1 cm−1), consistent with hexacoordinate cobalt. The data support a model in which AnhE acts as a dimeric metallochaperone to deliver cobalt to ANHase. This study provides insight into the maturation of NHases and metallochaperone function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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