MétaCan
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Enregistrement W2055331835 · doi:10.1074/jbc.m512531200

The Glycosaminoglycan Attachment Regions of Human Aggrecan

2006· article· en· W2055331835 sur OpenAlexaff
Elida Rodriguez, S. Roland, Anna Plaas, Peter J. Roughley

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSulfationTandem repeatChemistryGlycosaminoglycanChondroitin sulfateProteoglycanAggrecanAmino acidKeratan sulfateBiochemistryStereochemistryPeptide sequenceGeneExtracellular matrix

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggrecan possesses both chondroitin sulfate (CS) and keratan sulfate (KS) chains attached to its core protein, which reside mainly in the central region of the molecule termed the glycosaminoglycan-attachment region. This region is further subdivided into the KS-rich domain and two adjacent CS-rich domains (CS1 and CS2). The CS1 domain of the human is unique in exhibiting length polymorphism due to a variable number of tandem amino acid repeats. The focus of this work was to determine how length polymorphism affects the structure of the CS1 domain and whether CS and KS chains can coexist in the different glycosaminoglycan-attachment domains. The CS1 domain possesses several amino acid repeat sequences that divide it into three subdomains. Variation in repeat number may occur in any of these domains, with the consequence that CS1 domains of the same length may possess different amino acid sequences. There was no evidence to support the presence of KS in either the CS1 or the CS2 domains nor the presence of CS in the KS-rich domain. The structure of the CS chains was shown to vary between the CS1 and CS2 domains, particularly in the adult, with variation occurring in chain length and the sulfation of the non-reducing terminal N-acetyl galactosamine residue. CS chains in the adult CS2 domain were shorter than those in the CS1 domain and possessed disulfated terminal residues in addition to monosulfated residues. There was, however, no change in the sulfation pattern of the disaccharide repeats in the CS chains from the two domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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