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Enregistrement W2055376430 · doi:10.1080/10520290802646619

A system for quantitative evaluation of fixatives for light microscopy using paraffin sections of kidney and brain

2009· article· en· W2055376430 sur OpenAlexafffund
J. A. Kiernan

Notice bibliographique

RevueBiotechnic & Histochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFixativeFixation (population genetics)PathologyGrading (engineering)MicroscopyBiologyFrozen section procedureMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A numerical scoring system is presented for evaluating structural fixation of certain mammalian tissues for light microscopy. Small pieces of rat's kidney and brain, tissues for which artifacts of fixation are well documented, were fixed in various fluids. Random code numbers hid their identities, and paraffin sections were stained to show nuclear chromatin, cytoplasm and extracellular materials. Two sections of each specimen were examined and awarded scores according to described schemes, for microanatomical and cytological fixation. The assessment was confined to preservation of structure; chemical changes were not taken into account. When the code was broken, the scores for both sections of each specimen from each fixative were added. The scores obtained (24 best to eight worst) are generally comparable to the grades (I-V) given for traditional fixatives by JR Baker. The criteria for quality of fixation were defined more explicitly than those for Baker's grading method, which used mouse testis as the test object. Assessments are presented for several traditional fixatives and for four zinc-formaldehyde mixtures. The scoring system should be useful for evaluating newly developed fixatives for animal tissues for light microscopic examination of paraffin sections. In an evaluation of four traditional fixatives and four zinc-formaldehyde mixtures, variation among three different observers was only +/-1 point on either side of the median score for microanatomical or cytological preservation by any of the eight fixatives. This approach has certain limitations, notably that the criteria for cytological fixation do not include the preservation of chromosomes or specific cytoplasmic organelles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,113

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0150,005
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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