In situ imaging of usnic acid in selected Cladonia spp. by vibrational spectroscopy
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we demonstrate the first in situ detection of usnic acid (UA) in selected species of the lichen Cladonia, using FPA-FTIR imaging and Raman microscopy. Fruticose lichens present a variety of defensive mechanisms, one of which is the production of UA. This polyketide secondary metabolite, produced by certain lichenized fungi, has a protective function for the lichen that includes a strong absorption in the ultraviolet range. Upon confirming the distinct spectral signature of UA in lichen tissue, we mapped its distribution in Cladonia arbuscula, Cladonia uncialis and Cladonia sulphurina tissues. Spectroscopic images were obtained from cryosectioned lichen fragments embedded in media and from hand-sectioned fragments that were media-free. UA was present in the pycnidia, and younger walls of C. arbuscula and C. uncialis, the spore-producing region of a C. uncialis apothecium, and in both the younger and older soredia of C. sulphurina. The localization of UA in lichens is an important precursor to future work that includes the identification of the gene cluster responsible for its biosynthesis. Our results show that FTIR and Raman imaging can be an effective way to study the distribution of natural products in lichens with micron-scale precision.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».