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Enregistrement W2055772691 · doi:10.1021/jp7100495

Significance of Cholesterol Methyl Groups

2008· article· en· W2055772691 sur OpenAlexafffund
Sanja Pöyry, Tomasz Róg, Mikko Karttunen, Ilpo Vattulainen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship Council
Mots-clésCholesterolChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cholesterol is an indispensable molecule in mammalian cell membranes. To truly understand its role in the functions of membranes, it is essential to unravel cholesterol's structure-function relationship determined by underlying molecular interactions. For this purpose, we elaborate on this issue by considering the previously proposed idea that cholesterol's effects on a number of physical properties of membranes have been optimized during the evolution by removal of its excess methyl groups from the alpha-face of cholesterol, thus "smoothening" the structure. Consequently, the methyl groups still attached to cholesterol are one of the most intriguing structural features of the molecule. An obvious question arises: Why do these methyl groups still exist, and could cholesterol properties be further optimized by their removal? Because of the nature of the biosynthetic pathways of cholesterol, and the evidence of decreased interactions between sterols and lipid acyl chains when methyl groups are present, it seems plausible that removal of the methyl groups might indeed lead to stronger ordering and condensing effects of the cholesterol molecule. Atomic-scale molecular dynamics simulations of numerous modified sterols embedded in saturated lipid bilayers demonstrate, however, that the issue is more subtle. The analysis reveals a complex interplay between the lipid acyl chains and the structural details of cholesterol. Changes in cholesterol structure typically do not improve its performance in terms of promoting membrane order. This view is substantiated by a detailed analysis of the simulation data. In particular, it highlights the importance of the methyl group C18 for cholesterol properties. The C18 group resides between the third and fourth ring of cholesterol on its "rough" beta-side, and the results provide compelling evidence that C18 is crucial for the proper orientation of the sterol. More generally, the data provide insight into the role of the methyl groups of cholesterol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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