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Enregistrement W2055813502 · doi:10.3109/09553002.2011.560994

High throughput screening of small molecule libraries for modifiers of radiation responses

2011· article· en· W2055813502 sur OpenAlexaff
Kwanghee Kim, Robert Damoiseaux, Andrew J. Norris, Leena Rivina, Kenneth A. Bradley, Michael E. Jung, Richard A. Gatti, Robert H. Schiestl, William H. McBride

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Radiation Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of California, Los Angeles
Mots-clésDNA damageDrug discoverySmall moleculeIn vivoBiologyPharmacophoreHigh-throughput screeningBiochemistryComputational biologyChemistryDNACell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: An unbiased approach of drug discovery through high-throughput screening (HTS) of libraries of chemically defined and bioactive small molecule compounds was used to identify modulators of radiation injury with an emphasis on radioprotectors and mitigators rather than radiosensitisers. Assay system endpoints included radiation-induced genotoxicity and DNA damage in yeast and apoptosis in murine lymphocytes. Large-scale data mining of chemically diverse libraries identified agents that were effective with all endpoints. HTS of bioactive compound libraries against murine lymphocytes profiled tetracycline and fluoroquinolone antibiotics and cyclopiazonic acid as having activity, and structure-activity analysis showed a common pharmacophore. Purine nucleosides, the interferon inducer tilorone, and linoleic acid were also identified as potential mitigators of radiation damage that often were also radioprotective. Many of these compounds enhance DNA repair, have anti-inflammatory activity, and stimulate hematopoiesis. Selected compounds within these initial verified hits from both types of libraries identified potent mitigators of lethal whole body irradiation (WBI) in mice. CONCLUSION: In spite of the fact that in vitro HTS has limitations and is unable to fully recapitulate all aspects of the complex in vivo acute radiation response, it identified several classes of molecules that had activity as radioprotectors and radiomitigators of the hematopoietic system in vivo. In the future, addition of 3-dimensional (3-D) or stem cell cultures or pathway analysis, may improve the power of HTS, but our findings indicate that common, evolutionary conserved, canonical pathways can be identified that could be exploited to mitigate radiation-induced defects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,525
Score d'incertitude au seuil0,430

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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