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Enregistrement W2055844502 · doi:10.1097/00002030-200305230-00004

Quantitative ex vivo analysis of functional virus-specific CD8 T lymphocytes in the blood and genital tract of HIV-infected women

2003· article· en· W2055844502 sur OpenAlexaff
Rupert Kaul, Paul Thottingal, Joshua Kimani, Peter Kiama, Charles W Waigwa, Job J. Bwayo, Francis A. Plummer, Sarah Rowland‐Jones

Notice bibliographique

RevueAIDS · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyCD8BiologyCervixLymphocyteBlood samplingImmune systemVirologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: CD8 T lymphocytes are important in HIV-1 control and mediate virus-specific immunity in the blood and genital tract. The induction and monitoring of mucosal CD8 cell responses will be an important component of HIV-1 vaccine trials, but information regarding the frequency, phenotype and function of genital tract CD8 cell responses is lacking. METHODS: Simultaneous blood and cervical cytobrush samples were obtained from 16 HIV-1-infected Kenyan sex workers. Epitope-specific CD8 T lymphocyte frequencies in the blood and genital tract were analysed after short-term peptide incubation and intracellular cytokine staining for interferon-gamma (IFN gamma). RESULTS: Cervical sampling resulted in adequate cell numbers for analysis in 10/16 women. Background IFN gamma production was higher in CD3+/CD8+ lymphocytes from the genital tract than from blood (0.48% versus 0.1%; P < 0.01). Responses to staphylococcal enterotoxin B were detected in cervical CD8 lymphocytes from 10/10 women, at a similar frequency to blood (16.7% in cervix and 13.3% in blood; P = 0.4). HIV-1-specific responses were detected the cervix of 8/10 women, with a trend to higher response frequencies in the genital tract than blood (2.1% versus 0.8%; P = 0.09). Co-expression of integrin CD103 (alpha E beta 7), a mucosal marker, was used to confirm the mucosal origin of cervical responses. CONCLUSIONS: Cytobrush sampling and intracellular cytokine staining is well suited to the analysis of cervical CD8 cell responses. The frequency of functional virus-specific CD3+/CD8+ T cells is similar in the genital tract and blood of HIV-1-infected women. The role of genital tract CD8 cell responses in HIV-1 control warrants further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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