<i>Caspase Recruitment Domain-Containing Protein 15</i> Mutations in Patients with Colorectal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
The caspase recruitment domain-containing protein 15 (CARD15) plays a crucial role in mediating the innate immune response. Mutations within this protein have been shown to be independent risk factors for the development of Crohn's disease in Caucasians. As Crohn's disease patients are at increased risk of developing sporadic colorectal cancer, it is conceivable that genetic variability within CARD15 may also play a role in determining susceptibility to this gastrointestinal malignancy in individuals without Crohn's disease. This hypothesis is supported by the findings of two case-control studies that found the frequencies of CARD15 mutations were significantly elevated in Polish and Greek colorectal cancer patients. Given the results of these previous studies, we examined whether the high incidence of sporadic colorectal cancer observed in New Zealand Caucasians was due to mutations within CARD15. To answer this question, we genotyped 133 colorectal cancer patients and 201 Caucasian controls for R702W, G908R, 1007fs, and P268S. Chi(2) Testing found that the combined frequency of R702W, G908R, and 1007fs was significantly elevated in colorectal cancer patients compared with controls (P = 0.001; odds ratio, 2.8; 95% confidence interval, 1.5-5.4), but no association was detected between tumor behavior or age of disease onset and CARD15 mutations in our colorectal cancer cohort. This study is the first to explore the link between CARD15 mutations and colorectal cancer in New Zealand Caucasians. Our results strongly suggest that CARD15 influences susceptibility to colorectal cancer, but we have found no evidence to indicate that CARD15 mutations predict the clinicopathologic characteristics of this disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».