Natural Outbreak of a Bacterial Fruit Rot of Cantaloupe in Georgia Caused by <i>Acidovorax avenae</i> subsp. <i>citrulli</i>
Notice bibliographique
Résumé
In April and July 1999, cantaloupe plants (Cucumis melo) from commercial greenhouses and fields in Grady, Colquitt, Mitchell, and Tift counties, GA, exhibited severe foliar necrosis and a fruit rot. Foliar symptoms were V-shaped, necrotic lesions occurring at the margin of the leaf and extending inward toward the midrib. Symptoms on the fruit surface were observed after net development and occurred randomly as round, necrotic, sunken spots or cracks a few millimeters in diameter. A soft rot originating from lesions on the surface of the fruit expanded into the flesh. Approximately 5% of the fruits were affected. Bacteria recovered from cantaloupe fruit and leaf tissues produced nonfluorescent, smooth, off-white colonies on King's medium B. Characteristic of Acidovorax avenae subsp. citrulli, the bacteria produced pits in carboxymethyl cellulose media (WFB 44), and reduced Tween 80 to give a visible precipitate on WFB 68 media (1). Based on fatty acid analysis, all strains were identified as A. avenae subsp. citrulli by Microbial Identification System software, version 3.6 (MIDI, Newark, DE), and similarity indices of 0.06, 0.79, 0.21, and 0.43 were recorded for strains recovered form Grady, Tift, Colquitt, and Mitchell counties, respectively. Using specific oligonucleotide primers (WFB 1/2) (2), PCR conducted on DNA from each strain yielded a 390-bp DNA fragment, confirming similarity to A. avenae subsp. citrulli. Indirect enzyme-linked immunosorbent assay with genus-specific antibodies also verified that the bacteria were Acidovorax spp. Pathogenicity of the A. avenae subsp. citrulli strains was confirmed by inoculating and observing symptom development on 2-week-old watermelon seedlings. Although all strains were identified and confirmed as A. avenae subsp. citrulli, restriction fragment length polymorphism data indicated that the Tift County strain was distinguishable from the others, suggesting that inoculum for these outbreaks may have originated from at least two different sources. References: (1) R. D. Gitaitis. 1993. Development of a seedborne assay for watermelon fruit botch. Pages 9-18 in: Proc. 1st Int. Seed Testing Assoc. Plant Dis. Commit., Ottawa, Canada. (2) R. R. Walcott and R. D. Gitaitis. (Abstr.) Phytopathology 88(suppl.):S92, 1998.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».