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Enregistrement W2055996804 · doi:10.1021/ac049482d

Electrochemical Detection of Single-Nucleotide Mismatches:  Application of M-DNA

2004· article· en· W2055996804 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésMonolayerDuplex (building)ChemistryDNANucleotideDielectric spectroscopyDNA sequencingAnalytical Chemistry (journal)CrystallographyElectrodeElectrochemistryBiochemistryChromatographyGenePhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The detection of a single-nucleotide mismatch in unlabeled duplex DNA by electrochemical methods is presented. Impedance spectroscopy is used to characterize a perfect duplex monolayer and three DNA monolayers differing in the position of the mismatch. The monolayers were studied as B-DNA (normal duplex DNA) and after conversion to M-DNA (a metalated duplex). Modeling of the impedance data to an equivalent circuit provides parameters that are useful in discriminating the four monolayer configurations. The resistance to charge transfer, R(CT), was lower for all duplexes after conversion to M-DNA. Contrary to expectations, R(CT) was also found to decrease for duplexes containing a mismatch. However, R(CT) was found to be diagnostic for mismatch detection. In particular, the difference in R(CT) between B- and M-DNA (deltaR(CT)) decreased from 190(22) omega.cm(2) for a perfectly matched duplex to 95(20), 30(20), and 85(20) omega.cm(2) for a mismatch at the top (distal), middle, and bottom (proximal) positions of the monolayer with respect to the gold surface. Further, a method to form loosely packed single-stranded (ss)-DNA monolayers by duplex dehybridization that is able to rehybridize to target strands is presented. Rehybridization efficiencies were in the range of 40-70%. Under incomplete hybridization conditions, the R(CT) was the same for matched and mismatched duplexes under B-DNA conditions. However, deltaR(CT) between B- and M-DNA, under incomplete hybridization, still provided a distinction. The deltaR(CT) for a perfect duplex was 76(12) omega.cm(2), whereas a mismatch in the middle of the sequence yielded a deltaR(CT) value of 30(15) omega.cm(2). The detection limit was measured and the impedance methodology reliably detected single DNA base pair mismatches at concentrations as low as 100 pM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle