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Enregistrement W2056016810 · doi:10.13034/cysj-2014-006

Spider silk protein structure analysis by FTIR and STXM spectromicroscopy techniques

2014· article· en· W2056016810 sur OpenAlexafffundvenue
J. Normandeau, Chris van Kessel, David N. Nicholson, B. Rahusaar Routledge, A. Fawcett, L. Lim-Cole, Charmaine Condy, Nicole J. Sylvain, Tracy L. Walker, Ferenc Borondics

Notice bibliographique

RevueJournal of Student Science and Technology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSilk-based biomaterials and applications
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)University of Toronto
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSILKSpiderSpider silkChemistryFourier transform infrared spectroscopyInfrared spectroscopyPolymer chemistryMaterials scienceNuclear chemistryCrystallographyChemical engineeringBiologyOrganic chemistryEcologyComposite material

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spider silk displays incredible strength and elas¬ticity for its size and weight.[1] These properties have sparked interest in determining the protein structures of the silk fibers allowing for the pro¬duction of synthetic silks.[2] This study compares the mid-infrared (Mid IR) spectra of silk from five different spider species to investigate the com-monalities between species and web type. The results demonstrate the Mid IR spectra from all types of spider silk to be similar, showing protein peaks in the Amide I and II regions. To study the environmental effects of the acid solution on the silk protein structure, two of the five species’ silk: Black & Yellow Orb Weaver (Argiope aurantia) and Black Widow (Latrodectus hesperus), were exposed to either rain water or 0.001 M sulphuric acid solution, similar to acid rain in pH. Spectra obtained at the Mid IR beamline and the data obtained from the X-ray Absorption Near Edge Spectroscopy (XANES) were compared for these samples to see the effect of the acid rain-like solu¬tion on the silk proteins. No conclusive evidence from the data is present to suggest that the acid rain solution had an effect on the protein structures of either type of spider silk. La soie d’araignée est à la fois robuste et flexible pour sa taille et son poids.[1] Ces propriétés ont piqué la curiosité de déterminer la structure des protéines des fibres de soie qui pourrait permettre éventuelle¬ment la production des soies synthétiques.[2] Cette étude compare les spectres mi- infrarouges (Mi IR) de soie de cinq espèces différentes d’araignée afin de trouver des similitudes entre les espèces et les genres de toiles. Les résultats démontrent que les spectres mi- infrarouges de tout type de soie d’araignée étudié sont similaires, présentant des apogées de protéines dans les régions de l’Amide I et II. Afin d’étudier les effets environnementaux d’une solution acide sur la structure de la proté¬ine de soie, la soie de deux des cinq espèces, le orbe tisserand noir et jaune (Argiope aurantia) et la veuve noire (Latrodectus Hesperus), ont été expo¬sé soit à la pluie naturelle soit à une solution d’acide sulfurique 0.001 M qui est proche au pH de la pluie acide. Les spectres obtenus à l’onde dirigée Mi IR et les données obtenues de l’absorption de la radi¬ographie près du seuil de la spectroscopie (ARSS) ont été comparés de ces échantillons afin de con¬stater l’effet de la solution d’acide sulfurique sur des protéines de soie. Il n’y avait aucune preuve probante des données suggérant que la solution d’acide sulfurique avait un effet sur la structure des protéines de soie des araignées étudié.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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