Combined Polymorphism Analysis of Glutathione S-transferase M1/G1 and Interleukin-1B (IL-1B)/Interleukin 1-Receptor Antagonist (IL-1RN) and Gastric Cancer Risk in an Omani Arab Population
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Host genetics have been implicated in gastric cancer carcinogenesis. Polymorphisms of glutathione S-transferase (GST) M1 and G1 and of interleukin-1B (IL-1B) and interleukin-1 receptor antagonist (IL-1RN) were shown to increase gastric cancer predisposition in several studies. To our knowledge, this is the first report on the combined analysis of polymorphisms GSTM1/G1 and IL-1B/IL-1RN genes in gastric adenocarcinoma. METHODS: Genomic DNA was extracted from peripheral blood of 107 control subjects and 107 gastric cancer patients. Analysis for the GSTM1 and GSTT1 gene polymorphisms was performed by multiplex polymerase chain reaction. The DNA samples were analyzed using the TaqMan allelic discrimination test for the polymorphism of IL-1B at positions-31. The variable number of tandem repeats of IL-1RN was genotyped using polymerase chain reaction followed by agarose gel electrophoresis. RESULTS: There were no statistically significant associations between the GSTM1/G1 or IL-1B-31 genes and gastric cancer risk. There was a statistical association between the presence of the IL-1RN*2 allele and gastric cancer (odds ratio 2.2, 95% confidence interval=1.2-3.7, P=0.01). Combined analysis showed that a combination of the null GSTM1 genotype and carriers of IL-1RN*2 was associated with a statistically significant correlation with gastric cancer (odds ratio=3.6, 95% confidence interval=1.4-9.4, P=0.008). CONCLUSIONS: The current study suggests that the individual variation in both the cellular inflammatory modulator IL-1RN and the antioxidative property of GSTM1 may predispose individuals to an increased risk of gastric cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».