An Analysis of Genetic Diversity and Inbreeding in Wuchereria bancrofti: Implications for the Spread and Detection of Drug Resistance
Notice bibliographique
Résumé
Estimates of genetic diversity in helminth infections of humans often have to rely on genotyping (immature) parasite transmission stages instead of adult worms. Here we analyse the results of one such study investigating a single polymorphic locus (a change at position 200 of the beta-tubulin gene) in microfilariae of the lymphatic filarial parasite Wuchereria bancrofti. The presence of this genetic change has been implicated in benzimidazole resistance in parasitic nematodes of farmed ruminants. Microfilariae were obtained from patients of three West African villages, two of which were sampled prior to the introduction of mass drug administration. An individual-based stochastic model was developed showing that a wide range of allele frequencies in the adult worm populations could have generated the observed microfilarial genetic diversity. This suggests that appropriate theoretical null models are required in order to interpret studies that genotype transmission stages. Wright's hierarchical F-statistic was used to investigate the population structure in W. bancrofti microfilariae and showed significant deficiency of heterozygotes compared to the Hardy-Weinberg equilibrium; this may be partially caused by a high degree of parasite genetic differentiation between hosts. Studies seeking to quantify accurately the genetic diversity of helminth populations by analysing transmission stages should increase their sample size to account for the variability in allele frequency between different parasite life-stages. Helminth genetic differentiation between hosts and non-random mating will also increase the number of hosts (and the number of samples per host) that need to be genotyped, and could enhance the rate of spread of anthelmintic resistance.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».