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Enregistrement W2056647393 · doi:10.3417/2010023

Assembling the Tree of the Monocotyledons: Plastome Sequence Phylogeny and Evolution of Poales<sup>1</sup>

2010· article· en· W2056647393 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAnnals of the Missouri Botanical Garden · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSister groupPhylogenetic treeTaxonBiologyPhylogeneticsBotanyCladeEvolutionary biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The order Poales comprises a substantial portion of plant life (7% of all angiosperms and 33% of monocots) and includes taxa of enormous economic and ecological significance. Molecular and morphological studies over the past two decades, however, leave uncertain many relationships within Poales and among allied commelinid orders. Here we present the results of an initial project by the Monocot AToL (Angiosperm Tree of Life) team on phylogeny and evolution in Poales, using sequence data for 81 plastid genes (exceeding 101 aligned kb) from 83 species of angiosperms. We recovered highly concordant relationships using maximum likelihood (ML) and maximum parsimony (MP), with 98.2% mean ML bootstrap support across monocots. For the first time, ML resolves ties among Poales and other commelinid orders with moderate to strong support. Analyses provide strong support for Bromeliaceae being sister to the rest of Poales; Typhaceae, Rapateaceae, and cyperids (sedges, rushes, and their allies) emerge next along the phylogenetic spine. Graminids (grasses and their allies) and restiids (Restionaceae and its allies) are well supported as sister taxa. MP identifies a xyrid clade (Eriocaulaceae, Mayacaceae, Xyridaceae) sister to cyperids, but ML (with much stronger support) places them as a grade with respect to restiids graminids. The conflict in resolution between these analyses likely reflects long-branch attraction and highly elevated substitution rates in some Poales. All other familial relationships within the order are strongly supported by both MP and ML analyses. Character-state mapping implies that ancestral Poales lived in sunny, fire-prone, at least seasonally damp/wet, and possibly nutrient-poor sites, and were animal pollinated. Five subsequent shifts to wind pollination—in Typhaceae, cyperids, restiids, Ecdeiocoleaceae, and the vast PACCMAD-BEP clade of grasses—are significantly correlated with shifts to open habitats and small, inconspicuous, unisexual, and nectar-free flowers. Prime ecological movers driving the repeated evolution of wind pollination in Poales appear to include open habitats combined with the high local dominance of conspecific taxa, with the latter resulting from large-scale disturbances, combined with tall plant stature, vigorous vegetative spread, and positive ecological feedback. Reproductive assurance in the absence of reliable animal visitation probably favored wind pollination in annuals and short-statured perennials of Centrolepidaceae in ephemerally wet depressions and windswept alpine sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,933
Score d'incertitude au seuil0,187

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle