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Enregistrement W2056781336 · doi:10.1136/jmg.2006.043091

Phenocopies in BRCA1 and BRCA2 families: evidence for modifier genes and implications for screening

2006· article· en· W2056781336 sur OpenAlexaff
Adrian L. Smith, Anthony Moran, Marie Boyd, M. Bulman, A Shenton, Letitia Smith, R Iddenden, Emma R. Woodward, Fiona Lalloo, Eamonn R. Maher, D. Gareth Evans

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensChristie (Canada)
Organismes subventionnairesBreast Cancer Research TrustNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésPhenocopyBreast cancerProbandFamily historyGenetic testingCancerGeneticsPopulationMedicineGenetic counselingOncologyMutationIncidence (geometry)Internal medicineBiologyGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The identification of BRCA1 and BRCA2 mutations in familial breast cancer kindreds allows genetic testing of at-risk relatives. Those who test negative are usually reassured and additional breast cancer surveillance is discontinued. However, we postulated that in high-risk families, such as those seen in clinical genetics centres, the risk of breast cancer might be influenced not only by the BRCA1/BRCA2 mutation but also by modifier genes. One manifestation of this would be the presence of phenocopies in BRCA1/BRCA2 kindreds. METHODS: 277 families with pathogenic BRCA1/BRCA2 mutations were reviewed and 28 breast cancer phenocopies identified. The relative risk of breast cancer in those testing negative was assessed using incidence rates from our cancer registry based on local population. RESULTS: Phenocopies constituted up to 24% of tests on women with breast cancer after the identification of the mutation in the proband. The standardised incidence ratio for women who tested negative for the BRCA1/BRCA2 family mutation was 5.3 for all relatives, 5.0 for all first-degree relatives (FDRs) and 3.2 (95% confidence interval 2.0 to 4.9) for FDRs in whose family all other cases of breast and ovarian cancer could be explained by the identified mutation. 13 of 107 (12.1%) FDRs with breast cancer and no unexplained family history tested negative. CONCLUSION: In high-risk families, women who test negative for the familial BRCA1/BRCA2 mutation have an increased risk of breast cancer consistent with genetic modifiers. In light of this, such women should still be considered for continued surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,632
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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