MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2056885047 · doi:10.1139/w01-046

Modification of the protein expression pattern induced in the nitrogen-fixing actinomycete<i>Frankia</i>sp. strain ACN14a-tsr by root exudates of its symbiotic host<i>Alnus glutinosa</i>and cloning of the<i>sodF</i>gene

2001· article· en· W2056885047 sur OpenAlexvenueno aff
Yasser Hammad, J Maréchal, Benoît Cournoyer, Philippe Normand

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrankiaBiologyIsoelectric pointStrain (injury)MicrobiologySuperoxide dismutaseRoot noduleRhizosphereGel electrophoresisBotanyNitrogen fixationBiochemistryBacteriaGeneticsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two-dimensional (2-D) polyacrylamide gel electrophoresis was used to detect proteins induced in Frankia sp. strain ACN14a-tsr by root exudates of its symbiotic host, Alnus glutinosa. The 5 most prominent proteins were purified from 2-D gels and characterized by N-terminal sequencing. All of these proteins had a high percentage of similarity with known stress proteins. One protein match was the Fe superoxide dismutase (Fe-SOD), another was a tellurite resistance protein (Ter), the third was a bacterioferritin comigratory protein (Bcp); and two matches, differing only by their isoelectric point, were the same small heat shock protein (Hsp), a major immune reactive protein found in mycobacteria. This suggests that the symbiotic microorganism Frankia, first responds with a normal stress response to toxic root products of its symbiotic host plant. To confirm its identity, the gene corresponding to the Fe-SOD protein, sodF was isolated from a genomic library by a PCR-approach and sequenced. It is the first stress response gene characterized in Frankia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetLegume Nitrogen Fixing SymbiosisTravaux en français237 207