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Enregistrement W2056893663 · doi:10.1093/jnci/djv036

Prediction of Breast Cancer Risk Based on Profiling With Common Genetic Variants

2015· article· en· W2056893663 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalUniversité de MontréalMcGill UniversityUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteMedical Research and Materiel CommandMedical Research CouncilMinistero dello Sviluppo EconomicoAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailRadboud Universitair Medisch CentrumNational Health and Medical Research CouncilOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeMedizinischen Hochschule HannoverNorges ForskningsrådUniversitair Medisch Centrum GroningenCenters for Disease Control and PreventionInstitut National Du CancerLeids Universitair Medisch CentrumAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKWF KankerbestrijdingVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingLigue Contre le CancerKuopion Yliopistollinen SairaalaKarolinska InstitutetHerlev HospitalCanadian Institutes of Health ResearchGeneral Secretariat for Research and TechnologySundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådMinistry of Education and Science of the Russian FederationBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekRussian Foundation for Basic ResearchMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationLon V. Smith FoundationRadboud UniversiteitUniversiteit LeidenRobert Bosch StiftungFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenNational Cancer InstituteCancer Institute NSWNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionAcademy of FinlandKing's College LondonRoswell Park Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKVrije Universiteit AmsterdamErasmus Universiteit RotterdamMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterFondation du cancer du sein du QuébecGenome CanadaItä-Suomen YliopistoAgency for Science, Technology and ResearchDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationDeutsches KrebsforschungszentrumCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthFondation de FranceNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchUniversity of CambridgeGovernment of CanadaHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriVanderbilt UniversityGénome QuébecAgence Nationale de la RechercheU.S. Department of Health and Human ServicesMayo ClinicBreast Cancer Research FoundationSusan G. Komen for the CureU.S. ArmyUniversity of WestminsterCancer Council TasmaniaFrancis Crick InstituteErasmus Medisch CentrumNational Institutes of HealthVanderbilt-Ingram Cancer Center
Mots-clésBreast cancerProfiling (computer programming)OncologyComputational biologyInternal medicineMedicineBiologyCancerComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Data for multiple common susceptibility alleles for breast cancer may be combined to identify women at different levels of breast cancer risk. Such stratification could guide preventive and screening strategies. However, empirical evidence for genetic risk stratification is lacking. METHODS: We investigated the value of using 77 breast cancer-associated single nucleotide polymorphisms (SNPs) for risk stratification, in a study of 33 673 breast cancer cases and 33 381 control women of European origin. We tested all possible pair-wise multiplicative interactions and constructed a 77-SNP polygenic risk score (PRS) for breast cancer overall and by estrogen receptor (ER) status. Absolute risks of breast cancer by PRS were derived from relative risk estimates and UK incidence and mortality rates. RESULTS: There was no strong evidence for departure from a multiplicative model for any SNP pair. Women in the highest 1% of the PRS had a three-fold increased risk of developing breast cancer compared with women in the middle quintile (odds ratio [OR] = 3.36, 95% confidence interval [CI] = 2.95 to 3.83). The ORs for ER-positive and ER-negative disease were 3.73 (95% CI = 3.24 to 4.30) and 2.80 (95% CI = 2.26 to 3.46), respectively. Lifetime risk of breast cancer for women in the lowest and highest quintiles of the PRS were 5.2% and 16.6% for a woman without family history, and 8.6% and 24.4% for a woman with a first-degree family history of breast cancer. CONCLUSIONS: The PRS stratifies breast cancer risk in women both with and without a family history of breast cancer. The observed level of risk discrimination could inform targeted screening and prevention strategies. Further discrimination may be achievable through combining the PRS with lifestyle/environmental factors, although these were not considered in this report.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,856
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle