Pulsed EPR Determination of the Distance between Heme Iron and FMN Centers in a Human Inducible Nitric Oxide Synthase
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian nitric oxide synthase (NOS) is a homodimeric flavo-hemoprotein that catalyzes the oxidation of L-arginine to nitric oxide (NO). Regulation of NO biosynthesis by NOS is primarily through control of interdomain electron transfer (IET) processes in NOS catalysis. The IET from the flavin mononucleotide (FMN) to heme domains is essential in the delivery of electrons required for O(2) activation in the heme domain and the subsequent NO synthesis by NOS. The NOS output state for NO production is an IET-competent complex of the FMN-binding domain and heme domain, and thereby it facilitates the IET from the FMN to the catalytic heme site. The structure of the functional output state has not yet been determined. In the absence of crystal structure data for NOS holoenzyme, it is important to experimentally determine the Fe...FMN distance to provide a key calibration for computational docking studies and for the IET kinetics studies. Here we used the relaxation-induced dipolar modulation enhancement (RIDME) technique to measure the electron spin echo envelope modulation caused by the dipole interactions between paramagnetic FMN and heme iron centers in the [Fe(III)][FMNH(*)] (FMNH(*): FMN semiquinone) form of a human inducible NOS (iNOS) bidomain oxygenase/FMN construct. The FMNH(*)...Fe distance has been directly determined from the RIDME spectrum. This distance (18.8 +/- 0.1 A) is in excellent agreement with the IET rate constant measured by laser flash photolysis [Feng, C. J.; Dupont, A.; Nahm, N.; Spratt, D.; Hazzard, J. T.; Weinberg, J.; Guillemette, J.; Tollin, G.; Ghosh, D. K. J. Biol. Inorg. Chem. 2009, 14, 133-142].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».