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Enregistrement W2057029647 · doi:10.1021/bi901711w

Role of Juxtamembrane and Transmembrane Domains in the Mechanism of Natriuretic Peptide Receptor A Activation

2010· article· en· W2057029647 sur OpenAlexfundno aff
Marie Parat, Jonathan Blanchet

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHeart Failure Treatment and Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTransmembrane domainChemistryBiophysicsTransmembrane proteinConformational changeSignal transductionPeptideReceptorAlanineProtein structureHelix (gastropod)CysteineDimerAmino acidBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natriuretic peptide receptor A (NPRA) is a noncovalent homodimeric receptor, composed of an extracellular domain (ECD) with a ligand-binding site, a single transmembrane domain (TM), and an intracellular domain (ICD) exhibiting guanylyl cyclase activity. NPRA activation by atrial natriuretic peptide (ANP) leads to cGMP production, which plays important roles in cardiovascular homeostasis. Initial studies have shown that activation of NPRA involves a conformational change in the juxtamembrane domain (JM). However, crystallographic study of the soluble ECD of NPRA has failed to document JM structure, and the conformational change involved in transmembrane signal transduction is still unknown. To analyze this conformational change, we first sequentially substituted nine amino acids of the JM with a cysteine residue. By studying the mutant's capacity to form ANP-induced or constitutive covalent disulfide dimers, we evaluated the relative proximity of JM residues, before and after NPRA activation. These results obtained with the full-length receptor demonstrate a high proximity of specific JM residues and are in disagreement with crystallography data. We also tested the hypothesis that signal transduction involves a TM rotation mechanism leading to ICD activation. By introducing one to five alanine residues into the TM alpha-helix, we show that a TM rotation of 40 degrees leads to constitutive NPRA activation. We finally studied the role of the TM in NPRA dimerization. By using the ToxR system, we demonstrate that the last JM residues are required to stabilize the TM dimer. Using these experimental data, we generated a new molecular model illustrating the active conformation of NPRA, where the JM and TM are depicted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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