Prognostic significance of clinical, histopathological, and molecular characteristics of medulloblastomas in the prospective HIT2000 multicenter clinical trial cohort
Notice bibliographique
Résumé
This study aimed to prospectively evaluate clinical, histopathological and molecular variables for outcome prediction in medulloblastoma patients. Patients from the HIT2000 cooperative clinical trial were prospectively enrolled based on the availability of sufficient tumor material and complete clinical information. This revealed a cohort of 184 patients (median age 7.6 years), which was randomly split at a 2:1 ratio into a training (n = 127), and a test (n = 57) dataset in order to build and test a risk score for this population. Independent validation was performed in a non-overlapping cohort (n = 83). All samples were subjected to thorough histopathological investigation, CTNNB1 mutation analysis, quantitative PCR, MLPA and FISH analyses for cytogenetic variables, and methylome analysis. By univariable analysis, clinical factors (M-stage), histopathological variables (large cell component, endothelial proliferation, synaptophysin pattern), and molecular features (chromosome 6q status, MYC amplification, subgrouping) were found to be prognostic. Molecular consensus subgrouping (WNT, SHH, Group 3, Group 4) was validated as an independent feature to stratify patients into different risk groups. When comparing methods for the identification of WNT-driven medulloblastoma, this study identified CTNNB1 sequencing and methylation profiling to most reliably identify these patients. After removing patients with particularly favorable (CTNNB1 mutation, extensive nodularity) or unfavorable (MYC amplification) markers, a risk score for the remaining "intermediate molecular risk" population dependent on age, M-stage, pattern of synaptophysin expression, and MYCN copy-number status was identified, with speckled synaptophysin expression indicating worse outcome. Test and independent validation of the score confirmed significant discrimination of patients by risk profile. Methylation subgrouping and CTNNB1 mutation status represent robust tools for the risk stratification of medulloblastoma. A simple clinico-pathological risk score was identified, which was confirmed in a test set and by independent clinical validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».