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Enregistrement W2057063586 · doi:10.1021/pr700602q

MALDI-MS Monitoring of Differential Biomolecule Secretion from Human Lung Cells in Vitro Following Incubation with <150 Particles

2008· article· en· W2057063586 sur OpenAlexafffund
Allen E. Haddrell, Stephen Van Den Eeden, George R. Agnes

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInhalation and Respiratory Drug Delivery
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Foundation for Climate and Atmospheric Sciences
Mots-clésProinflammatory cytokineChemistryPopulationBiomoleculeMass spectrometryIncubationBiophysicsParticle (ecology)BiochemistryBiologyChromatographyImmunologyInflammationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Knowledge of how the chemical composition of a given ambient particle affects varied biological response upon inhalation is of considerable interest regarding the pathogenesis of respiratory and cardiovascular diseases. Characterization of initiating events, using measurements of proinflammatory mediator differential expression by lung tissues, is an objective of our studies. Results demonstrating the capability to monitor changes in the secreted proteome of a human lung cell line culture dosed with <150 particles, for incubation periods ranging from 30 min to 24 h using matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) mass spectrometry, are presented. Each population of particles was created within an electrodynamic balance to have the same size and chemical composition prior to being deposited onto a culture of A549 cells. The carbon particles, and the lipopolysaccharide (52 pg/particle) containing carbon particles, were 6.3 microm in diameter. Numerous biomolecules are observable in the mass spectra of supernatants of lung cells. The relative abundance of many of these biomolecules changes as a function of particle type and incubation time, suggesting the ion signal intensities observed are indicative of the relative differential expression of these compounds, some of which could be proinflammatory mediators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,277

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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