MALDI-MS Monitoring of Differential Biomolecule Secretion from Human Lung Cells in Vitro Following Incubation with <150 Particles
Notice bibliographique
Résumé
Knowledge of how the chemical composition of a given ambient particle affects varied biological response upon inhalation is of considerable interest regarding the pathogenesis of respiratory and cardiovascular diseases. Characterization of initiating events, using measurements of proinflammatory mediator differential expression by lung tissues, is an objective of our studies. Results demonstrating the capability to monitor changes in the secreted proteome of a human lung cell line culture dosed with <150 particles, for incubation periods ranging from 30 min to 24 h using matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) mass spectrometry, are presented. Each population of particles was created within an electrodynamic balance to have the same size and chemical composition prior to being deposited onto a culture of A549 cells. The carbon particles, and the lipopolysaccharide (52 pg/particle) containing carbon particles, were 6.3 microm in diameter. Numerous biomolecules are observable in the mass spectra of supernatants of lung cells. The relative abundance of many of these biomolecules changes as a function of particle type and incubation time, suggesting the ion signal intensities observed are indicative of the relative differential expression of these compounds, some of which could be proinflammatory mediators.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».