Specificity of the Synergistic Anion for Iron Binding by Ferric Binding Protein from <i>Neisseria gonorrhoeae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Ferric binding protein in Neisseria gonorrhoeae (nFbpA) transports iron from outer membrane receptors for host proteins across the periplasm to a permease in an alternative pathway to the use of siderophores in some pathogenic bacteria. Phosphate and nitrilotriacetate, both at pH 8, and vanadate at pH 9 are shown to be synergistic in promoting ferric binding to nFbpA, in contrast to carbonate and sulfate. Interestingly, only phosphate produces the fully closed conformation of nFbpA as defined by native electrophoresis. The role of phosphate was probed by constructing three mutants: Q58E, Q58R, and G140H. The anion and iron binding properties of the Q58E mutant are similar to the wild-type protein, implying that one phosphate oxygen is a hydrogen bond donor and may in part define the specificity of nFbpA for phosphate over sulfate. Phosphate is a weakly synergistic anion in the Q58R and G140H mutants, and these mutants do not form completely closed structures. Ferric binding was investigated by both isothermal titration and differential scanning calorimetry. The apparent affinity of nFbpA for iron in a solution of 30 mM citrate is 1 order of magnitude larger in the presence (K(app)= 1.7 x 10(5) M(-1)) of phosphate than in its absence (K(app) = 1.6 x 10(4) M(-1)) at pH 7. Similar results were obtained at pH 8. This increase in affinity with phosphate as well as the formation of closed structure allows nFbpA to compete for free ferric ions in solution and suggests that ferric binding to nFbpA is regulated by the synergistic phosphate anion at sites of iron uptake.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».