A Novel Dnmt3a Isoform Produced from an Alternative Promoter Localizes to Euchromatin and Its Expression Correlates with Activede Novo Methylation
Notice bibliographique
Résumé
Previous studies have shown that the Dnmt3b gene encodes multiple variants via alternative splicing. However, only one form of Dnmt3a has been identified to date. We report here the discovery of a small form of Dnmt3a, denoted Dnmt3a2, from both human and mouse. The transcript encoding Dnmt3a2 is initiated from a downstream intronic promoter. As a result, the Dnmt3a2 protein lacks the N-terminal 223 (human) or 219 (mouse) amino acid residues of the full-length Dnmt3a. Recombinant Dnmt3a2 protein displayed similar cytosine methyltransferase activity as Dnmt3a in vitro. However, Dnmt3a and Dnmt3a2 exhibited strikingly different subcellular localization patterns. Unlike Dnmt3a, which was concentrated on heterochromatin, Dnmt3a2 displayed a localization pattern suggestive of euchromatin association. Dnmt3a2 is the predominant form in embryonic stem cells and embryonal carcinoma cells and can also be detected from testis, ovary, thymus, and spleen, whereas Dnmt3a is expressed at low levels ubiquitously. Comparison of human embryonal carcinoma cell lines with breast/ovarian cancer cell lines indicates that DNMT3A2 expression correlates with high de novo methylation activity. These findings suggest that Dnmt3a and Dnmt3a2 may have distinct DNA targets and different functions in development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».