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Enregistrement W2057440605 · doi:10.1007/s13361-012-0533-5

Dissociation Kinetics of the Streptavidin–Biotin Interaction Measured Using Direct Electrospray Ionization Mass Spectrometry Analysis

2012· article· en· W2057440605 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Glycomics CentreUniversity of Washington
Mots-clésChemistryStreptavidinElectrospray ionizationDissociation (chemistry)Mass spectrometryAnalytical Chemistry (journal)HomotetramerDissociation constantReaction rate constantTandem mass spectrometryArrhenius equationBiotinKineticsChromatographyPhysical chemistryActivation energy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dissociation rate constants (k (off)) for the model high affinity interaction between biotin (B) and the homotetramer of natural core streptavidin (S(4)) were measured at pH 7 and temperatures ranging from 15 to 45 °C using electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS). Two different approaches to data analysis were employed, one based on the initial rate of dissociation of the (S(4) + 4B) complex, the other involving nonlinear fitting of the time-dependent relative abundances of the (S(4) + iB) species. The two methods were found to yield k (off) values that are in good agreement, within a factor of two. The Arrhenius parameters for the dissociation of the biotin-streptavidin interaction in solution were established from the k (off) values determined by ESI-MS and compared with values measured using a radiolabeled biotin assay. Importantly, the dissociation activation energies determined by ESI-MS agree, within 1 kcal mol(-1), with the reported value. In addition to providing a quantitative measure of k (off), the results of the ESI-MS measurements revealed that the apparent cooperative distribution of (S(4) + iB) species observed at short reaction times is of kinetic origin and that sequential binding of B to S(4) occurs in a noncooperative fashion with the four ligand binding sites being kinetically and thermodynamically equivalent and independent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,453

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,002
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle