Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein F/H Proteins Modulate the Alternative Splicing of the Apoptotic Mediator Bcl-x
Notice bibliographique
Résumé
Bcl-x is a member of the Bcl-2 family of proteins that are key regulators of apoptosis. The Bcl-x pre-mRNA is alternatively spliced to yield Bcl-x(S) and Bcl-x(L), two isoforms that have been associated, respectively, with the promotion and the prevention of apoptosis. We have investigated some of the elements and factors involved in the production of these two splice variants. Deletion mutagenesis using a human Bcl-x minigene identifies two regions in exon 2 that modulate Bcl-x 5'-splice site selection in human HeLa cells. One region (B3) is located upstream of the Bcl-x(L) 5'-splice site and enforces Bcl-x(L) production in cells and splicing extracts. The other region (B2) is located immediately downstream of the 5'-splice site of Bcl-x(S) and favors Bcl-x(S) production in vivo and in vitro. A 30-nucleotide G-rich element (B2G) is responsible for the activity of the B2 element. We show that recombinant heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) F and H proteins bind to B2G, and mutating the G stretches abolishes binding. Moreover, the addition of hnRNP F to a HeLa extract improved the production of the Bcl-x(S) variant in a manner that was dependent on the integrity of the G stretches in B2G. Consistent with the in vitro results, small interfering RNA-mediated RNA interference targeting hnRNP F and H decreased the Bcl-x(S)/Bcl-x(L) ratio of plasmid-derived and endogenously produced Bcl-x transcripts. Our results document a positive role for the hnRNP F/H proteins in the production of the proapoptotic regulator Bcl-x(S.).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».