On Ligand Binding Energies in Porphyrinic Systems
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Energy decomposition analysis is a powerful tool to study the bond properties of molecules. Here, we used a recent implementation by P. Su and H. Li (J. Chem. Phys. 131 (2009) 014102) to test the method for investigations of ligand binding to medium sized molecules (30–40 atoms). We studied the properties of the bond between porphyrins or phthalocyanines with central metals without (Mg) or with a closed d shell (Zn and Cd) to ligands binding via various row II and III atoms (nitrogen, oxygen, phosphorus and sulphur) using various methods and basis sets. Several interesting results could be deduced: In the porphyrins, ligands binding via a nitrogen atom were preferred to those binding via oxygen and sixfold coordination was readily available for magnesium as central metal atom as opposed to zinc and cadmium derivatives which also showed a weaker bond strength. In phthalocyanines, a tendency to form fivefold coordination was also seen for magnesium compounds and bonds to nitrogen and oxygen had the same strength. Ligation to row III elements created only weak bonds that were prone to fluctuations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».