MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2057592907 · doi:10.1186/bcr1847

Can clinically relevant prognostic subsets of breast cancer patients with four or more involved axillary lymph nodes be identified through immunohistochemical biomarkers? A tissue microarray feasibility study

2008· article· en· W2057592907 sur OpenAlexafffund
Simon J. Crabb, Chris Bajdik, Samuel Leung, Caroline Speers, Hagen Kennecke, David G. Huntsman, Karen A. Gelmon

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensCentre for Advancing Health OutcomesUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Breast Cancer Research AllianceSanofi
Mots-clésBreast cancerImmunohistochemistryMedicineAxillary lymph nodesInternal medicineOncologyBiomarkerTissue microarraySurgical oncologyProportional hazards modelEstrogen receptorProgesterone receptorLog-rank testCytokeratinPathologyCancerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Primary breast cancer involving four or more axillary lymph nodes carries a poor prognosis. We hypothesized that use of an immunohistochemical biomarker scoring system could allow for identification of variable risk subgroups. METHODS: Patients with four or more positive axillary nodes were identified from a clinically annotated tissue microarray of formalin-fixed paraffin-embedded primary breast cancers and randomized into a 'test set' and a 'validation set'. A prospectively defined prognostic scoring model was developed in the test set and was further assessed in the validation set combining expression for eight biomarkers by immunohistochemistry, including estrogen receptor, human epidermal growth factor receptors 1 and 2, carbonic anhydrase IX, cytokeratin 5/6, progesterone receptor, p53 and Ki-67. Survival outcomes were analyzed by the Kaplan-Meier method, log rank tests and Cox proportional-hazards models. RESULTS: A total of 313 eligible patients were identified in the test set for whom 10-year relapse-free survival was 38.3% (SEM 2.9%), with complete immunohistochemical data available for 227. Tumor size, percentage of positive axillary nodes and expression status for the progesterone receptor, Ki-67 and carbonic anhydrase IX demonstrated independent prognostic significance with respect to relapse-free survival. Our combined biomarker scoring system defined three subgroups in the test set with mean 10-year relapse-free survivals of 75.4% (SEM 7.0%), 35.3% (SEM 4.1%) and 19.3% (SEM 7.0%). In the validation set, differences in relapse-free survival for these subgroups remained statistically significant but less marked. CONCLUSION: Biomarkers assessed here carry independent prognostic value for breast cancer with four or more positive axillary nodes and identified clinically relevant prognostic subgroups. This approach requires refinement and validation of methodology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBreast Cancer ResearchMême sujetBreast Cancer Treatment StudiesTravaux en français237 207